陈苹果和孩子们都非常压抑，同情那些被困的人类，也同情那些遭遇凄惨的动物。
他们在无人的荒岛上过了一段鲁滨逊漂流记里一样的日子，采摘野果，寻找淡水，制作小船，搭建木屋。他们认识了黑鲸的其他朋友，也是饱受人类摧残后吃了变异果的海洋生物。
在这段相处中，他们知道了这个岛屿和变异果的由来。
曾经有一位科学家，不忍他们被残忍的送上了实验台，屡次和其他人建议，采用不伤害动物本身的实验发放，遭到了群嘲。在科学家弥留之际，他研发了变异果并把它送给了黑鲸。
变异后的黑鲸解救了其他小伙伴，并且变异果的果核重新发育，长成了变异树，所有逃来这里的动物都吃了变异果，发生了变异。
死里逃生的动物们在变异后，并没有像黑鲸一样，满足于自由自在的生活，他们被仇恨蒙住了眼睛，打算报复人类。
道不同不相为谋的黑鲸和其他只想自有生活的动物居住在了海底，而打算报复人类的动物生活在了海岛上。
黑鲸告诉师生，每到月亮变成最细的下弦月时，会有人类的行船从附近经过，他会在那个时候把师生们驮到那附近，那船只上的水手拯救他们。
他们盼到了下弦月之时，然而黑鲸发现，那些船只的航线和以往不同，他们在向变异岛屿驶过来。
黑鲸最得力的助手红螃蟹去打探，发现这些船只是战船，打算对小岛发动战争。
黑鲸担心小岛上伙伴的安危，让红螃蟹去报信，没料到红螃蟹被控制了。原来，海岛上的动物打算正式和人类发动战争。
陈苹果让黑鲸照顾孩子们，自己一人潜入小岛，打算拯救红螃蟹。
在这个过程中，他打探到了小岛动物们打算对人类投毒的事情，同时，他也遇到了潜入小岛的其他人类，打探到他们赶尽杀绝的计划。
如果放任两方开战，那必然是双方都伤亡惨重。
陈苹果不顾自己的性命，充当了两方的传声筒，并且串改了原本互相充满挑衅的发言，用诚挚打动了双方。
在陈苹果的努力下，原本剑拔弩张的氛围消散了，变异动物们答应了和解，他们不再报复人类，原本关押在岛上的人类也都悉数放回。
而人类也放弃攻打变异岛，让这里成为动物们的天堂。
当一切归于平静，陈苹果才想起来，要带孩子们回去，他们忘了搭乘人类的行船。
黑鲸说，他可以和其他变异生物携手，游出这片海域。
岛上的动物们搭建了一艘小船，取名诺亚方舟，陈苹果和孩子们一起搭乘小船，在海底生物的帮助下，向海的另一面飘去。
行船过程中，他们遇到了一片海雾，陈苹果很警觉，急忙抱住孩子们，然而终归晚了一步，陈苹果的视线里只剩下一片白茫茫。
陈苹果再醒来时，都瘫坐在一片草地上，一旁是他们租来的小车。
头顶的阳光灿烂，微风吹拂，空气中没有海水的咸湿，一切仿佛一场梦。
五个孩子好像很疲惫，睡得安详。陈苹果也不想动弹，知道感觉脚踝有一点刺痛。
他低头，发现旁边有一个小水洼，水洼中爬上来一只小螃蟹，对他阻拦了他的路很不满。
那只小螃蟹，很像当初他营救的
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